R Markdown en VSCode

Introducción

R Markdown en Visual Studio Code (VSCode) ofrece un entorno robusto para generar informes dinámicos y reproducibles. Integre a la perfección código R, texto narrativo y visualizaciones en documentos de calidad profesional.

Esta guía le ayudará a dominar la creación, ejecución y personalización de informes R Markdown directamente en VSCode.

Requisitos previos para R Markdown en VSCode

Antes de comenzar, asegúrese de que su entorno R en VSCode esté configurado correctamente:

• Siga Configuración de su entorno R en VSCode.
• Instalar los paquetes necesarios:
  • Paquete R: rmarkdown
  • Extensión VSCode: vscode-R
• Instale [Pandoc] (https://pandoc.org/installing.html) para la conversión de documentos si aún no está instalado.

Creación de su primer documento R Markdown en VSCode

Siga estos pasos para crear un nuevo archivo .Rmd en VSCode:

1. Creación de un nuevo archivo:

   • Haga clic en File > New File.
   • Guarde el archivo como report.Rmd.

2. Añadir encabezado YAML:

   El encabezado YAML define los metadatos del informe y el formato de salida:

   ---
   title: "My Analysis Report"
   author: "Your Name"
   date: "`r Sys.Date()`"
   output: html_document
   ---

3. Escribir contenido:

   Insertar fragmentos narrativos y de código R fácilmente:

   ## Introducción
   
   Este es un ejemplo introductorio:
   
   ```{r}
   summary(cars)
   ```

Ejecución de fragmentos de código R

Ejecute código R directamente dentro de su documento R Markdown:

• Ejecutar fragmento actual: Ctrl + Mayús + Intro (Windows/Linux) o Cmd + Mayús + Intro (Mac).
• Ejecutar línea o selección: Resalte el código, pulse Ctrl + Intro (Windows/Linux) o Cmd + Intro (Mac).

Los resultados aparecen en línea debajo de los fragmentos de código para su visualización y validación inmediatas.

Ejecución del documento R Markdown en VSCode

Generar informes dinámicos con R Markdown

Genere resultados reproducibles como HTML, PDF o Word:

1. Renderizar documento:
   • Abra la paleta de comandos (Ctrl + Shift + P) y seleccione RMarkdown: Render.
   • Elegir el formato deseado (HTML, PDF, Word).
2. Ver documento generado:
   • El archivo renderizado aparece en el directorio de su proyecto.
   • La salida HTML se puede previsualizar directamente en el navegador o a través de la extensión de previsualización en vivo de VSCode.

Personalizar el resultado de R Markdown

Adapte fácilmente los resultados de su informe en el encabezado YAML:

• Temas y estilos personalizados:

  output:
    html_document:
      theme: cosmo
      highlight: haddock

• Informes parametrizados:

  Utilizar parámetros para personalizar informes de forma dinámica:

  params:
    data_file: "data.csv"

  Haga referencia a los parámetros en su código utilizando params$data_file.

Código R en línea para contenido dinámico

Incluya contenido dinámico, actualizado automáticamente, directamente dentro del texto narrativo:

A partir de `r Sys.Date()`, hay `r nrow(cars)` observaciones en el conjunto de datos.

Esto permite actualizaciones automáticas de su informe basadas en cambios de datos subyacentes.

Prácticas recomendadas para crear informes R Markdown

Mejore la legibilidad, el rendimiento y la reproducibilidad:

• Organización del código:

  Etiquetar y organizar fragmentos de forma lógica:

  ```{r data-import, echo=FALSE}
  data <- read.csv("data.csv")
  ```

• Uso del almacenamiento en caché para mejorar el rendimiento:

  Evitar volver a ejecutar cálculos costosos:

  ```{r expensive-model, cache=TRUE}
  model <- lm(mpg ~ wt + hp, data = mtcars)
  ```

• Gestión de la visibilidad:

  Controlar la visibilidad del código y los resultados:

  ```{r plot-results, echo=FALSE}
  plot(mtcars$wt, mtcars$mpg)
  ```

Consejos para mejorar R Markdown en VSCode

• Vista previa en vivo: Instale Vista previa en vivo para obtener comentarios instantáneos mientras edita R Markdown.
• Plegado de código: Navegue de forma eficiente por documentos de gran tamaño utilizando las funciones integradas de plegado de código de VSCode.
• Linting & Formatting: Mantener archivos R Markdown limpios y consistentes con los paquetes lintr y styler.

Documento de ejemplo completo de R Markdown

Aquí hay un ejemplo completo que demuestra las características principales de R Markdown:

---
title: 'Example Analysis with R Markdown'
author: 'Datanovia'
date: '`r Sys.Date()`'
output: html_document
---

## Introducción

Un ejemplo que muestra las capacidades de R Markdown.

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

## Resumen de datos

Descripción general del conjunto de datos `cars` integrado:

```{r}
summary(cars)
```

## Diagrama de dispersión: velocidad frente a distancia

Representación visual de los datos:

```{r}
plot(cars$speed, cars$dist,
     xlab = "Speed (mph)",
     ylab = "Stopping Distance (ft)",
     main = "Speed vs. Stopping Distance")
```

## Conclusión

R Markdown simplifica la generación de informes dinámicos y reproducibles mediante la integración de análisis, narrativa y elementos visuales.

Ejemplo de salida de ejecución:

Ejecución del documento R Markdown en VSCode

Conclusión

Dominar R Markdown en VSCode permite crear de forma eficiente informes dinámicos, profesionales y reproducibles. Integre narrativa, código y visualizaciones sin esfuerzo, agilizando su flujo de trabajo analítico.

Referencias y lecturas adicionales

• Configuración de su entorno R en VSCode
• Configuraciones de VSCode recomendadas para la programación en R
• Programación interactiva en R y ejecución de código en VSCode
• Documentación oficial de R Markdown
• Guía de instalación de Pandoc

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Nota

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