Dissecção de RNA-Seq da diferenciação de células plasmáticas revela novos reguladores transcricionais

Kassambara A, Herviou L, Ovejero S, Jourdan M, Thibaut C, Vikova V, Pasero P, Elemento O, Moreaux J. A dissecação orientada por dados de sequenciamento de RNA da diferenciação de células plasmáticas humanas revela novos reguladores de transcrição em potencial. Leukemia. 2021. Faça o download do PDF

Resumo do estudo

As células plasmáticas (PCs) são fundamentais para o sistema imunológico adaptativo por meio da produção de anticorpos a longo prazo. Para entender o cenário transcricional subjacente à diferenciação de células plasmáticas humanas (PCD), este estudo gerou um conjunto de dados de RNA-seq temporal que captura vários estágios da PCD.

• 6374 genes expressos diferencialmente foram agrupados em quatro padrões dinâmicos de expressão gênica

• A análise de enriquecimento de vias identificou processos biológicos conhecidos e novos, incluindo:

  • Biossíntese de heme
  • Conjugação da glutationa

• O estudo revelou novos reguladores transcricionais com expressão específica de estágio, tais como:

  • BATF2
  • BHLHA15/MIST1
  • EZH2
  • WHSC1/MMSET
  • BLM

A validação funcional destacou a função do BLM na regulação da proliferação e sobrevivência das células durante a PCD. Essas descobertas definem um roteiro transcricional de PCD e abrem novos caminhos para a compreensão da biologia do PC.

Importante

Neste estudo, Alboukadel Kassambara foi o primeiro autor, liderando o projeto desde a concepção conceitual até a análise e interpretação dos dados. Ele conduziu a análise completa de RNA-seq, identificou programas transcricionais específicos do estágio e escreveu o manuscrito, estabelecendo um recurso fundamental para a compreensão da diferenciação de células plasmáticas humanas.

Citação

Publication: In Leukemia
Data: 6 de abril, 2021
Tipo: Artigo de periódico
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Contribuições científicas

Nota

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