Kassambara A, Hose D, Moreaux J, Walker BA, Protopopov A, Rème T, Pellestor F, Pantesco V, Jauch A, Morgan G, Goldschmidt H, Klein B. Os genes com expressão de pico estão agrupados em regiões cromossômicas específicas com valor prognóstico no mieloma múltiplo. Hematologia. 2012. Faça o download do PDF
Resumo do estudo
As translocações cromossômicas no mieloma múltiplo (MM) podem levar a uma expressão anormalmente alta (‘expressão de pico’) de genes ligados à sobrevivência e à progressão do tumor.
Este estudo:
Foram investigados genes com expressão de spike em células plasmáticas malignas de 206 pacientes com MM recém-diagnosticados
Identificou 2.587 genes expressos por picos
Descobriu que 36,7% deles se agrupam significativamente dentro de 149 (sub)bandas cromossômicas
Desenvolveu uma pontuação de banda de pico com base nesses clusters, que se correlaciona fortemente com o prognóstico do paciente:
- 23,8% dos pacientes tiveram sobrevida ruim usando esse escore
- O escore foi independente de marcadores conhecidos, como t(4;14) e del17p
- Os resultados foram validados em uma coorte independente de 345 pacientes
Este trabalho apresenta um método poderoso de estratificação para MM usando picos de expressão de genes e localizações cromossômicas.
Neste estudo, Alboukadel Kassambara foi o primeiro autor, realizando a análise transcriptômica e a interpretação dos dados. Ele identificou genes expressos por pico, desenvolveu a pontuação de banda de pico e validou seu valor prognóstico. Ele também contribuiu para a redação do manuscrito, estabelecendo um novo modelo de estratificação baseado na expressão cromossômica no mieloma múltiplo.
Citação
Publication: In Hematologia
Data: 1º de abril, 2012
Tipo: Artigo de periódico
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Contribuições científicas
Aqui estão mais resumos científicos de autoria ou coautoria de Alboukadel Kassambara. Essas contribuições abrangem biologia computacional, bioinformática, bioestatística, aprendizado de máquina e multiômica, com foco em imuno-oncologia e pesquisa translacional.