Kassambara A, Jourdan M, Bruyer A, Robert N, Pantesco V, Elemento O, Klein B, Moreaux J. Globale miRNA-Expressionsanalyse identifiziert neue Schlüsselregulatoren für die Differenzierung von Plasmazellen und bösartigen Plasmazellen. Nucleic Acid Research (Nukleinsäureforschung). 2017. PDF herunterladen
Zusammenfassung der Studie
MicroRNAs (miRNAs) sind kleine nicht-kodierende RNAs, die die Expression ihrer mRNA-Ziele abschwächen. Hier haben wir eine neue Methode und ein R-Paket entwickelt, um miRNA-mRNA-Zielinteraktionen abzuleiten, die während eines bestimmten biologischen Prozesses funktionell sein könnten.
Mit dieser Methode haben wir zum ersten Mal eine umfassende integrierte Analyse von miRNAs und mRNAs während der normalen menschlichen Plasmazelldifferenzierung (PCD) beschrieben. Unsere Ergebnisse zeigen:
- 63 miRNAs mit signifikanten zeitlichen Veränderungen während normaler PCD
- Ein hoch zuverlässiges Netzwerk von 295 Zielbeziehungen, das 47 miRNAs und 141 mRNAs umfasst
- Neue regulatorische Verbindungen, einschließlich miR-30b/c/d, die auf IRF4, PRDM1, ELL2, ARID3A zielen
- 24 miRNAs überexprimiert im Multiplen Myelom (MM), die sich mit normalen PCD-Regulatoren überschneiden
Diese Studie identifiziert neue miRNA-Schlüsselkandidaten, die sowohl die normale PCD als auch die Biologie bösartiger Plasmazellen regulieren.
Zitat
Publication: In Nucleic Acid Research (Nukleinsäureforschung)
Datum: Juni 2, 2017
Typ: Zeitschriftenartikel
PDF: PDF herunterladen
Wissenschaftliche Beiträge
Hier sind weitere wissenschaftliche Abstracts, die von Alboukadel Kassambara verfasst oder mitverfasst wurden. Diese Beiträge umfassen computergestützte Biologie, Bioinformatik, Biostatistik, maschinelles Lernen und Multi-Omics, mit Schwerpunkt auf Immuno-Onkologie und translationaler Forschung.
