Kassambara A, Jourdan M, Bruyer A, Robert N, Pantesco V, Elemento O, Klein B, Moreaux J. L'analyse globale de l'expression des miARN identifie de nouveaux régulateurs clés de la différenciation des plasmocytes et des plasmocytes malins. Recherche sur les acides nucléiques. 2017. Télécharger le PDF
Résumé de l’étude
Les microARN (miARN) sont de petits ARN non codants qui atténuent l’expression de leurs cibles ARNm. Nous avons développé une nouvelle méthode et un package R pour déduire des interactions candidates entre miARN et ARN cible qui pourraient être fonctionnelles au cours d’un processus biologique donné.
En utilisant cette méthode, nous avons décrit, pour la première fois, une analyse intégrée complète des miARN et des ARNm au cours de la différenciation des plasmocytes humains normaux (PCD). Nos résultats révèlent:
- 63 miARNs avec des changements temporels significatifs au cours de la PCD normale
- Un réseau de haute confiance de 295 relations cibles impliquant 47 miARN et 141 ARNm
- De nouveaux liens réglementaires, y compris miR-30b/c/d ciblant IRF4, PRDM1, ELL2, ARID3A
- 24 miARNs surexprimés dans le myélome multiple (MM) qui se chevauchent avec les régulateurs normaux de la PCD
Cette étude identifie de nouveaux miARN clés candidats régulant à la fois la PCD normale et la biologie des plasmocytes malins.
Citation
Publication: In Recherche sur les acides nucléiques
Date : 2 juin, 2017
Type : Article de revue
PDF : Télécharger le PDF
< Retourner à tous les résumés
Contributions scientifiques
Voici d’autres résumés scientifiques dont l’auteur ou le co-auteur est Alboukadel Kassambara. Ces contributions couvrent la biologie informatique, la bioinformatique, la biostatistique, l’apprentissage automatique et la multi-omique, avec un accent sur l’immuno-oncologie et la recherche translationnelle.