Alaterre E, Vikova V, Kassambara A, Bruyer A, Robert N, Requirand G, Bret C, Herbaux C, Vincent L, Cartron G, Elemento O, Moreaux J. Auf RNA-Sequenzierung basierender transkriptomischer Score mit prognostischem und therapeutischem Wert beim Multiplen Myelom. Zeitschrift für personalisierte Medizin. 2021. PDF herunterladen
Zusammenfassung der Studie
Diese Studie nutzt RNA-Sequenzierungsdaten zur Entwicklung eines Genexpressions-basierten Risikoscores, der die Prognose stratifiziert und die Behandlungsempfindlichkeit beim Multiplen Myelom (MM) vorhersagt.
Ein 267-Gene-Score wurde konstruiert und in zwei unabhängigen Kohorten validiert:
- n = 674 (MMRF CoMMpass)
- n = 76 (externe Validierung)
Hochrisikopatienten zeigten eine Anreicherung von Gensignaturen, die mit:
- Interferon response, IL-6 signaling
- MYC activation, cell proliferation
- Hypoxia, stemness, and epigenetic deregulation
Der Score war auch korreliert mit somatischen Mutationsprofilen
Theranostische Erkenntnisse: Stratifizierung des Ansprechens auf EZH2-, MELK-, TOPK/PBK- und Aurora-Kinase-Inhibitoren
In dieser Studie trug Alboukadel Kassambara zur Datenanalyse und Visualisierung bei und unterstützte die Entwicklung, Validierung und Interpretierbarkeit des RNA-seq-basierten Transkriptom-Scores beim Multiplen Myelom.
Zitat
Publication: In Zeitschrift für personalisierte Medizin
Datum: 30. September, 2021
Typ: Zeitschriftenartikel
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Wissenschaftliche Beiträge
Hier sind weitere wissenschaftliche Abstracts, die von Alboukadel Kassambara verfasst oder mitverfasst wurden. Diese Beiträge umfassen computergestützte Biologie, Bioinformatik, Biostatistik, maschinelles Lernen und Multi-Omics, mit Schwerpunkt auf Immuno-Onkologie und translationaler Forschung.
