Alaterre E, Vikova V, Kassambara A, Bruyer A, Robert N, Requirand G, Bret C, Herbaux C, Vincent L, Cartron G, Elemento O, Moreaux J. Score transcriptomique basé sur le séquençage de l'ARN avec des valeurs pronostiques et théranostiques dans le myélome multiple. Publié dans le Journal of Personalized Medicine. 2021. Télécharger le PDF
Résumé de l’étude
Cette étude exploite les données de séquençage ARN pour développer un ** score de risque basé sur l’expression génique** qui stratifie le pronostic et prédit la sensibilité au traitement dans le myélome multiple (MM).
Un score de 267 gènes a été construit et validé dans deux cohortes indépendantes:
- n = 674 (MMRF CoMMpass)
- n = 76 (validation externe)
Les patients à haut risque ont montré un enrichissement des signatures génétiques liées aux:
- Interferon response, IL-6 signaling
- MYC activation, cell proliferation
- Hypoxia, stemness, and epigenetic deregulation
Le score était également corrélé avec les profils de mutation somatique
Perspectives théranostiques : stratification de la réponse aux inhibiteurs de EZH2, MELK, TOPK/PBK et Aurora kinase
Dans cette étude, Alboukadel Kassambara a contribué à l’analyse et la visualisation des données, soutenant le développement, la validation et l’interprétabilité du score transcriptomique basé sur l’ARN-seq dans le myélome multiple.
Citation
Publication: In Publié dans le Journal of Personalized Medicine
Date : 30 septembre, 2021
Type : Article de revue
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Contributions scientifiques
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