Steer A, Chemlal D, Varlet E, Machura A, Kassambara A, Alaterre E, Requirand G, Robert N, Hirtz C, De Boussac H, Bruyer A, Moreaux J. P843 : Caractérisation métabolomique d'une lignée cellulaire humaine de myélome multiple pour étudier la résistance tumorale à différentes classes d'agents thérapeutiques. Hemasphere. 2022. Télécharger le PDF
Résumé de l’étude
La résistance aux médicaments dans le myélome multiple (MM) résulte souvent de la plasticité de la tumeur et des mécanismes de survie qui s’adaptent au stress thérapeutique. Cette étude a cherché à caractériser le phénotype métabolique des lignées cellulaires de MM et à l’associer à la résistance thérapeutique.
Un panel de 20 lignées cellulaires humaines de MM (HMCL) a été évalué pour l’activité métabolique en utilisant Seahorse XFe96 Mito Stress Assay. Mesures incluses:
- Taux de consommation d’oxygène (OCR)
- Taux d’acidification extracellulaire (ECAR)
- Capacité respiratoire de réserve (SRC)
Le profilage transcriptomique (RNAseq) a ensuite été utilisé pour développer un score métabolomique basé sur les gènes dérivé de 112 gènes glycolytiques et liés à OxPhos.
Principaux résultats
- Les lignées cellulaires ont montré des dépendances métaboliques distinctes (glycolytique vs mitochondriale)
- Le score métabolomique est fortement corrélé avec les résultats métaboliques fonctionnels
- Dans deux cohortes indépendantes de patients (MMRF CoMMpass, E-MTAB-362), un score métabolomique élevé prédit une mauvaise survie globale
- Une production élevée d’ATP mitochondrial est corrélée avec la résistance aux inhibiteurs du protéasome (P = 0,023)
Alboukadel Kassambara a contribué à l’intégration des données transcriptomiques, à la modélisation du score et aux analyses pronostiques cliniques, en aidant à valider le score métabolomique à travers des ensembles de données fonctionnelles et de patients.
Citation
Publication : Dans Hemasphere (Poster Abstract)
Date : 23 juin, 2022
Type : Présentation d’affiche
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Contributions scientifiques
Voici d’autres résumés scientifiques dont l’auteur ou le co-auteur est Alboukadel Kassambara. Ces contributions couvrent la biologie informatique, la bioinformatique, la biostatistique, l’apprentissage automatique et la multi-omique, avec un accent sur l’immuno-oncologie et la recherche translationnelle.